CN EN
P
产品中心
Product center

myBaits UCE探针

预设计 ——由专家设计,可立即使用

结果经验证——不断扩大的经同行评审的论文清单

流水线分析——简单、方便的数据分析

性价比高—— 多个远亲类群使用一套探针集

完整的解决方案——试剂盒包括所有必要的试剂

应用范围广——具有适用性高的通用Panels

联系我们
  • 产品简介
  • 实验数据
  • 引用文献

超保守元件(UCEs)是高度保守的基因组区域,在其侧翼有很多可变序列。因为许多基因组区域在大的分类范围内共享,在新物种和非模式物种的研究方面,这些关键区域作为系统发育的理想目标捕获候选区域已被定义和开发。Arbor Biosciences为各种分类学类群提供一系列即用型UCE探针,包括脊椎动物、昆虫和植物中鉴定出的类似的保守直系同源基因(COS)位点。


产品特点:

  • 预设计 ——由专家设计,可立即使用

  • 结果经验证——不断扩大的经同行评审的论文清单

  • 流水线分析——简单、方便的数据分析

  • 性价比高—— 多个远亲类群使用一套探针集

  • 完整的解决方案——试剂盒包括所有必要的试剂

  • 应用范围广——具有适用性高的通用Panels


产品应用:

  • 系统发生学

  • 群体遗传学

  • 生命之树

  • 侧翼区捕获


即用型PANELS:

脊椎动物    

  • 辐鳍鱼类 0.5Kv1

  • 鲈形目1Kv1

  • 骨鳔类2.7Kv1

  • 脊椎动物2.5Kv1、5Kv1和5Kv2B

无脊椎动物

  • 蛛形纲1.1Kv1

  • 蜘蛛目2Kv1

  • 鞘翅目1.1Kv1

  • 双翅目2.7Kv1

  • 半翅目2.7Kv1

  • 膜翅目1.5Kv1、2.5Kv2P、2.5Kv2A和2.5Kv2AB

  • 鳞翅目1.3Kv1

  • 新panels咨询


产品列表:

产品类别

产品货号

产品名称

产品规格

产品详情

辐鳍鱼类

305008.V5

myBaits UCE Actinopterygians 0.5Kv1

8 Rxn

含2001个探针(120 mer)
可以富集辐鳍鱼类中的500个UCE位点

305048.V5

myBaits UCE Actinopterygians 0.5Kv1

48 Rxn

305096.V5

myBaits UCE Actinopterygians 0.5Kv1

96 Rxn

鲈形目

306108.V5

myBaits UCE Acanthomorph 1Kv1

8 Rxn

含2628个探针(120 mer)
可以富集鲈形目中的1314个UCE位点

306148.V5

myBaits UCE Acanthomorph 1Kv1

48 Rxn

306196.V5

myBaits UCE Acanthomorph 1Kv1

96 Rxn

骨鳔鱼类

306308.V5

myBaits UCE Ostariophysan 2.7Kv1

8 Rxn

含6737个探针(120 mer)
可以富集骨鳔鱼类中的2708个UCE位点

306348.V5

myBaits UCE Ostariophysan 2.7Kv1

48 Rxn

306396.V5

myBaits UCE Ostariophysan 2.7Kv1

96 Rxn

菊科

305208.V5

myBaits COS Compositae 1Kv1

8 Rxn

含9678个探针(120 mer)
可以富集菊科中的1061个直系同源基因(COS)位点
经验证,此探针集在大量菊科及其近缘类群中可以富集>700个位点

305248.V5

myBaits COS Compositae 1Kv1

48 Rxn

305296.V5

myBaits COS Compositae 1Kv1

96 Rxn

脊椎动物

305608.V5

myBaits UCE Tetrapods 2.5Kv1

8 Rxn

含2560个探针(120 mer)
可以富集脊椎动物中的2386个UCE位点,其中鸟类和爬行动物2.2k,哺乳动物约1k

305648.V5

myBaits UCE Tetrapods 2.5Kv1

48 Rxn

305696.V5

myBaits UCE Tetrapods 2.5Kv1

96 Rxn

305708.V5

myBaits UCE Tetrapods 5Kv1

8 Rxn

含5472 个探针(120mer)
可以富集脊椎动物中的 5060 个 UCE位点,其中鸟类和爬行动物4k,哺乳动物约2-3k,两栖动物1k

305748.V5

myBaits UCE Tetrapods 5Kv1

48 Rxn

305796.V5

myBaits UCE Tetrapods 5Kv1

96 Rxn

306608.V5

myBaits Tetrapods 5Kv2B

8 Rxn

该版本已经针对化石或者粪便样本做过优化,探针的长度是80nt
与其他两款的区别:与5KV1版本覆盖物种基本相同,针对降解比较严重的样本效果会更好

306648.V5

myBaits Tetrapods 5Kv2B

48 Rxn

306696.V5

myBaits Tetrapods 5Kv2B

96 Rxn

蛛形纲

305108.V5

myBaits UCE Arachnida 1.1Kv1

8 Rxn

含14799个探针(120 mer)
可以富集蛛形纲(蜘蛛,螨虫,蝎子,盲蜘蛛及其近亲)中的1120个UCE位点

305148.V5

myBaits UCE Arachnida 1.1Kv1

48 Rxn

305196.V5

myBaits UCE Arachnida 1.1Kv1

96 Rxn

蜘蛛目

306408.V5

myBaits UCE Spider 2Kv1

8 Rxn

含15015个探针(120 mer)
可以富集蜘蛛目中>2000个UCE位点

306448.V5

myBaits UCE Spider 2Kv1

48 Rxn

306496.V5

myBaits UCE Spider 2Kv1

96 Rxn

鞘翅目

305908.V5

myBaits UCE Coleoptera 1.1Kv1

8 Rxn

含13674个探针(120 mer)
可以富集鞘翅目中的1172个UCE位点

305948.V5

myBaits UCE Coleoptera 1.1Kv1

48 Rxn

305996.V5

myBaits UCE Coleoptera 1.1Kv1

96 Rxn

双翅目

306008.V5

myBaits UCE Diptera 2.7Kv1

8 Rxn

含31328个探针(120 mer)
可以富集双翅目中的2711个UCE位点

306048.V5

myBaits UCE Diptera 2.7Kv1

48 Rxn

306096.V5

myBaits UCE Diptera 2.7Kv1

96 Rxn

半翅目

305808.V5

myBaits UCE Hemiptera 2.7Kv1

8 Rxn

含40207个探针(120 mer)
可以富集半翅目中的2731个UCE位点

305848.V5

myBaits UCE Hemiptera 2.7Kv1

48 Rxn

305896.V5

myBaits UCE Hemiptera 2.7Kv1

96 Rxn

膜翅目

305308.V5

myBaits UCE Hymenoptera 1.5Kv1

8 Rxn

含2749个探针(120 mer)
可以富集膜翅目(蚂蚁、蜜蜂、叶蜂和黄蜂)中的1510个UCE位点

305348.V5

myBaits UCE Hymenoptera 1.5Kv1

48 Rxn

305396.V5

myBaits UCE Hymenoptera 1.5Kv1

96 Rxn

305408.V5

myBaits UCE Hymenoptera 2.5Kv2P

8 Rxn

HymV1的扩展版本,含31829个探针(120 mer)
可以富集膜翅目(蚂蚁、蜜蜂、叶蜂和黄蜂)中的2590个UCE位点

305448.V5

myBaits UCE Hymenoptera 2.5Kv2P

48 Rxn

305496.V5

myBaits UCE Hymenoptera 2.5Kv2P

96 Rxn

305508.V5

myBaits UCE Hymenoptera 2.5Kv2A

8 Rxn

Hym2.5Kv2P的子集,仅含蚂蚁基因组探针9898个(120 mer)
可以富集2524个UCE位点和16个核基因外显子区域(外显子根据四种远缘蚂蚁物种设计,共12个基因)

305548.V5

myBaits UCE Hymenoptera 2.5Kv2A

48 Rxn

305596.V5

myBaits UCE Hymenoptera 2.5Kv2A

96 Rxn

306208.V5

myBaits UCE Hymenoptera 2.5Kv2AB

8 Rxn

Hym2.5Kv2P的子集,仅含蚂蚁和蜜蜂基因组探针9332个(120 mer)
可以富集2545个UCE位点和12个核基因外显子区域(7个基因)

306248.V5

myBaits UCE Hymenoptera 2.5Kv2AB

48 Rxn

306296.V5

myBaits UCE Hymenoptera 2.5Kv2AB

96 Rxn

鳞翅目

306508.V5

myBaits Lepidoptera 1.3Kv1

8 Rxn

含14363个探针(120 mer)
可以富集鳞翅目(蝴蝶、蛾类及其近缘物种)中的1381个UCE位点

306548.V5

myBaits Lepidoptera 1.3Kv1

48 Rxn

306596.V5

myBaits Lepidoptera 1.3Kv1

96 Rxn

其他物种UCE可定制,详情请联系我们。 现有定制案例:两栖类、珊瑚等。

image.png

BLAST 鸡、人类、老鼠和青蛙基因组中,脊椎动物5K UCE基因位点的比对。每个碱基的颜色是由相似度决定的(深=高,浅=低)。中部UCE区域的相似度,明显不同于与其直接相邻的基因组侧翼的相似度。

J. Starrett et al. (2017). High phylogenetic utility of an ultraconserved element probe set designed for Arachnida. Molecular Ecology Resources

J.E. McCormack et al. (2016). Sequence capture of ultraconserved elements from bird museum specimens. Molecular Ecology Resources

B.C. Faircloth et al. (2015). Target enrichment of ultraconserved elements from arthropods provides a genomic perspective on relationships among Hymenoptera. Molecular Ecology Resources

B.C. Faircloth et al. (2012). Ultraconserved Elements Anchor Thousands of Genetic Markers Spanning Multiple Evolutionary Timescales. Systematic Biology

TOP