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多重建库的福音:BIOO 1,536种UDI Adapter双重检验助力高通量测序

2020-01-07 17:37:07

随着测序样本通量的增加以及更高通量的测序仪的推广,客户对于混池(multiplexing)的需求愈加迫切。例如,Illumina®的Novaseq这种最高可以产生6TB数据的超高通量测序平台,容易出现样品标签跳跃(index hopping)的问题,必须有与之搭配使用的多种特殊设计的index和接头,以规避可能出现的标签跳跃,才能真正发挥其高通量的作用。为了满足客户的这些需求,BIOO Scientific(a company of PerkinElmer)最新推出了1,536种UDI Barcodes以供多重文库构建选择,并能够有效降低标签跳跃。


1. NEXTFLEX® UDI Barcodes (1-1,536) for Ultra High-Throughput Multiplexing

  • 1,536种UDI barcodes用于NGS多重文库构建,兼容Illumina®双端和单端测序

  • 每批产品都通过测序验证,确保接头纯度,保证测序数据的可靠性

  • 多达1,536(10 nt)种adapters正式销售中


最高样本通量的UDI选择—兼容Illumina®测序

BIOO Scientific最新推出的1,536种NEXTFLEX®Unique Dual Index ,设计出众,适合更广的混池(multiplexing)范围——用户可以在1个单独的run中进行任意2种样本到1,536种样本的多重测序。多种barcodes的选择可以有效减少run和run之间样品的交叉污染和串扰。NEXTFLEX® Unique Dual Index barcodes与NEXTFLEX®文库制备试剂盒搭配使用,适用于Illumina®单端、双端测序,或者Illumina®其他同类型工作流程的测序。

另有384种 NEXTFLEX® UDI barcodes(8 nt)的套装,适合样本量较小的用户使用。


通过缓解index hopping,保证最高水平的数据真实性

NEXTFLEX® Unique Dual Index barcodes在每个UDI adapter上使用两个独特的index,整个系列index的汉明距离至少为3,以提高容错率。

每个NEXTFLEX® Unique Dual Index barcodes都包含整个flow cell的结合位点、测序引物结合位点和index序列,因此PCR富集成为可选项。Illumina一些型号的高通量测序仪都使用Patterned Flow Cell Technology(PFCT),例如Illumina® NovaSeq®, HiSeq®3000/4000, 和 HiSeq® X 测序平台, 这些仪器容易出现样品标签错配(index misassignment)的问题。使用具有独特index的接头可以通过正确移除错配reads来提高数据真实性。每批产品都通过测序质检,确保接头纯度。


常见问题:

Q:NEXTFLEX® unique dual index barcodes是否经过纯度验证?

A:是的,每批adapters都要经过严格的QC程序,包括在llumina®MiSeq®测序仪上进行测序,以验证index序列的纯度。


Q: NEXTFLEX®unique dual index barcodes 是否通过功能验证?

A: 是的,每批adapters都要经过严格的QC程序,包括通过构建文库来验证barcoded adapter的功能。


Q: NEXTFLEX®unique dual index barcodes货期是多久?

A: 现货。


Q: 为什么 NEXTFLEX® unique dual index barcodes 只有 2 rxns/well (in 96-well plate)的包装?

A:NEXTFLEX® unique dual index barcodes的包装中每种barcode只有两个反应,这样可以减少重复使用同一包装造成的污染。


Q: 在使用NEXTFLEX® Unique Dual Index Barcodes时,只能进行双端测序吗?

A:不是,NEXTFLEX® Unique Dual Index Barcodes同时兼容双端和单端测序。I7 和I5 是进行分别读取,而不是从Read 1 到Read 2。


Q: 我可以在单端index实验中使用NEXTFLEX® Unique Dual Index Barcodes吗?

A: 可以,您可以将测序读取方式设置为只读取I7 index。


试剂盒组分

NEXTFLEX® Unique Dual Index Barcodes* (25 µM)

NEXTFLEX® Primer Mix** (50 µM)


* Unique Dual Index barcodes 为双链结构,请勿加热至室温以上。

**Primer Mix 2.0只能搭配NEXTFLEX® Rapid XP DNA-Seq kit和NEXTFLEX® Rapid DNA-Seq kit 2.0试剂盒使用;如需将这款primer mix与其他建库试剂盒搭配使用,需要进行稀释。

同样,BIOO Scientific也为客户准备了与RNA 文库构建搭配使用的 384 和1,536 重Unique Dual Index Barcodes。


2. NEXTFLEX®RNA-Seq 2.0 Unique Dual Index Barcodes

  • 可用于NGS多重RNA文库构建,兼容Illumina®双末端和单端测序

  • 每批产品都进行了功能验证,并通过测序检测index纯度

  • 可与NEXTFLEX® Rapid Directional RNA-Seq Kit 2.0搭配使用


适用于RNA测序建库的即用型UDI Barcodes

NEXTFLEX® RNA-seq 2.0 UDI barcodes (多达 384种)可用于多重RNA文库构建,兼容于Illumina 测序平台。这些barcodes (8-nt index) 浓度为6.25 µM ,进行RNA 文库构建时无需稀释,使用方便,与 NEXTFLEX® Rapid Directional RNA-Seq kit 2.0搭配使用,也可用于PCR-free RNA测序建库。

为了满足实验室对更大样本通量的需求,BIOO Scientific为用户提供1,536种 RNA-seq 2.0 UDI barcodes。


3. NEXTFLEX®RNA-Seq 2.0 Unique Dual Index Adapters (Set of 1,536)

  • 1,536种RNA-seq UDI barcodes用于NGS多重文库构建,兼容于Illumina®双末端和单端测序

  • 每批产品都通过测序验证,确保接头纯度,保证测序数据可靠性

  • 适用于 Illumina® NovaSeq® 测序

  • UDI adapters index 为10nt


超高样本通量的RNA-Seq 2.0 UDI选择,兼容Illumina 平台RNA测序

整个系列的 1,536种 NEXTFLEX® RNA-Seq 2.0 UDI barcodes (10-nt index) 浓度为 6.25 µM,与NEXTFLEX® Rapid Directional RNA-Seq kit 2.0 或者其他RNA 测序建库试剂盒搭配使用。


试剂盒组分

  • NEXTFLEX® RNA-Seq 2.0 Unique Dual Index Barcodes* (6.25 μM )

  • NEXTFLEX® Primer Mix 2.0** (50 μM )


* Unique Dual Index barcodes 为双链结构,请勿加热至室温以上。

** Primer Mix 2.0只能搭配NEXTFLEX® Rapid Directional RNA-Seq kit 2.0试剂盒使用;如需将这款primer mix 2.0与其他RNA建库试剂盒搭配使用,需要进行稀释。


产品信息

产品编号产品名称

规格
NOVA-514150NEXTFLEX®   Unique Dual Index Barcodes(BARCODES 1-96 )(25 µM)
192 rxns
NOVA-514151NEXTFLEX®   Unique Dual Index Barcodes(BARCODES 97-192 )(25 µM)
192 rxns
NOVA-514152NEXTFLEX®   Unique Dual Index Barcodes(BARCODES 193-288 )(25 µM)
192 rxns
NOVA-514153NEXTFLEX®   Unique Dual Index Barcodes(BARCODES 289-384 )(25 µM)
192 rxns
NOVA-534100

NEXTFLEX®   UDI Barcodes (1-1,536) for Ultra High-Throughput Multiplexing

(BARCODES 1-1,536)(25 µM)


3,072 rxns
NOVA-512920

NEXTFLEX®   RNA-Seq 2.0 Unique Dual Index Barcodes* (BARCODES 1-96)

(6.25 μM )


192 rxns
NOVA-512921

NEXTFLEX®   RNA-Seq 2.0 Unique Dual Index Barcodes* (BARCODES 93-192)

(6.25 μM )


192 rxns
NOVA-512922

NEXTFLEX®   RNA-Seq 2.0 Unique Dual Index Barcodes* (BARCODES 193-288)

(6.25 μM )


192 rxns
NOVA-512923

NEXTFLEX®   RNA-Seq 2.0 Unique Dual Index Barcodes* (BARCODES 289-384)

(6.25 μM )


192 rxns

NOVA-524100

NEXTFLEX®   RNA-Seq 2.0 Unique Dual Index Adapters (Set of 1,536) (6.25 μM )
3,072 rxns


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