
riboPOOL的主要优势:
任意物种
去除任意物种的rRNAs或高丰度mRNA:丰富的成品型目录可供选择,目录持续更新中;目录以外物种或RNA可以定制。
去除不依赖poly-A结构
适合非Ploy-A化的RNA(如snoRNA、lncRNA、组蛋白)的研究和原核生物。
广泛的起始量范围
在100 ng到5 μg的RNA起始量之间都有很好的去除效率。
riboPOOL 的特殊应用:
原核通用型riboPOOL与环境基因组学
原核通用型不仅可以广泛应用于各种原核生物样本(细菌、古生菌),还可以处理含有不同微生物的复杂样本,如环境基因组样本(如土壤、污泥)。
去除高丰度RNA
除rRNA之外, riboPOOL还可以去除组织特异性mRNA(如人血珠蛋白)或其他测序时出现的不相关的高丰度RNA。
可应用于Ribosome profiling
riboPOOLs 可以应用于ribosome profiling样本,更多信息,请联系我们。
复合型riboPOOL可以去除混合样本中的rRNA
复合型riboPOOL可以去除含多个物种的混合样本中的rRNA。客户可根据样本的组成比例混合2-4种成品型riboPOOL使用,如病原体感染的人体组织(人源+原核通用型)、人血液样本(人源+人血珠蛋白)。详情请联系我们咨询。
产品组分
实验流程
实验数据
引用文献
相关产品
1. riboPOOL 探针
组分
探针冻干粉
无核酸酶水
规格
2 nmol(20次),5 nmol(50次),10 nmol(100次)
2. riboPOOL 试剂盒
组分
探针冻干粉
无核酸酶水
缓冲液
链霉亲和素磁珠
乙醇沉淀纯化试剂
规格
6次(试用装,限购1次),12次,24次,96次
两种形式均提供试验方案(请联系我们咨询)
产品以冻干形式室温运输。
复溶后,在-20℃或以下的温度,可稳定保存6个月。建议分装储存,避免多次冻融。
工作流程快:完整工作流程约用时70min
riboPOOL 的数据
高效且精确的去除:人源和鼠源的riboPOOLs去除细胞质和线粒体rRNAs的效率 > 95%
Kim, I et al. (2019) Efficient depletion of ribosomal RNA for RNA sequencing in planarians. BMC Genomics 20, 909
Galmozzi, C. V. et. al (2019) Selective ribosome profiling to study interactions of translating ribosomes in yeast. Nat Protoc 14, 2279–2317
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