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riboPOOL核糖体RNA(rRNA)去除探针/试剂盒

riboPOOL的主要优势:


任意物种

去除任意物种的rRNAs或高丰度mRNA:丰富的成品型目录可供选择,目录持续更新中;目录以外物种或RNA可以定制。

成品目录-1.png

去除不依赖poly-A结构

适合非Ploy-A化的RNA(如snoRNA、lncRNA、组蛋白)的研究和原核生物。

广泛的起始量范围

在100 ng到5 μg的RNA起始量之间都有很好的去除效率。


riboPOOL 的特殊应用:


原核通用型riboPOOL与环境基因组学

原核通用型不仅可以广泛应用于各种原核生物样本(细菌、古生菌),还可以处理含有不同微生物的复杂样本,如环境基因组样本(如土壤、污泥)。


去除高丰度RNA

除rRNA之外, riboPOOL还可以去除组织特异性mRNA(如人血珠蛋白)或其他测序时出现的不相关的高丰度RNA。


可应用于Ribosome profiling

riboPOOLs 可以应用于ribosome profiling样本,更多信息,请联系我们。


复合型riboPOOL可以去除混合样本中的rRNA

复合型riboPOOL可以去除含多个物种的混合样本中的rRNA。客户可根据样本的组成比例混合2-4种成品型riboPOOL使用,如病原体感染的人体组织(人源+原核通用型)、人血液样本(人源+人血珠蛋白)。详情请联系我们咨询。

说明书

产品组分

实验流程

实验数据

引用文献

相关产品



1. riboPOOL 探针

组分

  • 探针冻干粉

  • 无核酸酶水

规格

2 nmol(20次),5 nmol(50次),10 nmol(100次)


2. riboPOOL 试剂盒

组分

  • 探针冻干粉

  • 无核酸酶水

  • 缓冲液

  • 链霉亲和素磁珠

  • 乙醇沉淀纯化试剂

规格

6次(试用装,限购1次),12次,24次,96次


两种形式均提供试验方案(请联系我们咨询)

  • 产品以冻干形式室温运输。

  • 复溶后,在-20℃或以下的温度,可稳定保存6个月。建议分装储存,避免多次冻融。


实验流程.png

工作流程快:完整工作流程约用时70min


riboPOOL 的数据

实验数据.png

高效且精确的去除:人源和鼠源的riboPOOLs去除细胞质和线粒体rRNAs的效率 > 95%


  • Kim, I et al. (2019) Efficient depletion of ribosomal RNA for RNA sequencing in planarians. BMC Genomics 20, 909

  • Galmozzi, C. V. et. al (2019) Selective ribosome profiling to study interactions of translating ribosomes in yeast. Nat Protoc 14, 2279–2317

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